雞攝入的飼料并沒有完全消化吸收，約有40%－70%的營養物被排出體外，因此雞糞在所有禽畜糞便當中養分是最高的。但是雞糞不被處理或腐熟而直接施用到作物上，則存在很大的害處及隱患：直接施在土壤中，在合適條件下發酵并產生大量的熱量，燒毀作物根系。同時雞糞本身帶有大量病菌，給作物帶來病害隱患。因此須將雞糞進行無害化處理和完全腐熟后才能施用于作物。

傳統方法是將雞糞密封堆漚，進行厭氧發酵，一般要3－4個月才能腐熟，現在通過生物技術，采用好氧發酵，腐熟速度比傳統的快10－20倍，將雞糞的蛋白質等大分子分解成小分子，作物可直接吸收。腐熟完全的雞糞已基本聞不到臭味。