近年來，農民對菌肥的認識逐漸提高，菌肥在蔬菜生產中的應用越來越廣泛，施用方法比化肥、有機肥嚴格，有特定的施用要求，使用微生物菌劑時要注意施用條件，嚴格按照產品使用說明書操作，否則難以獲得良好的施用效果。要想提高菌肥的使用效果，應在技術上掌握以下四點：

　　一、要求土壤墑情適宜。土壤太干或太濕都不利于菌肥肥效的發揮，適宜的土壤濕度為60%左右，即見干見濕的土壤濕度最為適宜。 

　　二、不能與殺菌劑混用。菌是菌肥的主要體現，若與殺菌劑混用，殺菌劑容易殺滅菌肥中的活性菌，降低菌肥的肥效。 

　　三、與化肥混用，要注意化肥用量不能過大。高濃度的化學物質對菌肥里的微生物有毒害作用，尤其注意不能與碳酸氫銨等堿性肥料和硝酸鈉等生理堿性肥料混用。 

　　四、不同種類的菌肥也不宜混用。目前，市場上的菌肥種類很多，其所含的活性菌不同，它們之間是否有相互抑制作用還不是很清楚，若相互抑制，則會降低肥效。

　　微生物菌劑主要通過微生物功能菌株在作物根表、根際和體內定植、繁殖和轉移，充分發揮菌株的促長、固氮、解磷、解鉀、抗病、抗逆和改良土壤等功能，達到增產、防病、改善品質和提高肥料利用率等作用效果，是修復土壤和生產無公害、綠色、有機食品的必選肥料。