生物有機肥是指特定功能微生物與主要以動植物殘體（如畜禽糞便、農作物秸稈等）為來源并經無害化處理、腐熟的有機物料復合而成的一類兼具微生物肥料和有機肥效應的肥料。生物有機肥根據作物的不同選擇不同的施肥方法，常用的施肥方法有：

　　撒施法：結合深耕或在播種時將生物有機肥均勻地施在根系集中分布的區域和經常保持濕潤狀態的土層中，做到土肥相融。

　　條狀溝施法：條播作物或葡萄、獼猴桃等果樹，開溝后施肥播種或在距離果樹5厘米處開溝施肥。

　　環狀溝施法：蘋果、桃、柑桔等幼年果樹，距樹干20--30厘米，繞樹干開一環狀溝，施肥后覆土。

　　放射狀溝施：蘋果、桃、柑桔等成年果樹，距樹干30厘米處，按果樹根系伸展情況向四周開4--5個50厘米長的溝，施肥后覆土。

　　穴施法：點播或移栽作物，如玉米、棉花、西紅柿等，將肥料施入播種穴，然后播種或移栽。 

　　拌種法：玉米、小麥等大粒種子，用4公斤生物有機肥與畝用種子量拌勻后一起播入土壤；油菜、煙草、蔬菜、花卉等小粒種子，用1公斤生物有機肥與畝用種子量拌勻后一起播入土壤。

　　蘸根法：對移栽作物，如水稻、西紅柿等，按生物有機肥加5份水配成肥料懸濁液，浸蘸苗根，然后定植。

　　蓋種肥法：開溝播種后，將生物有機肥均勻地覆蓋在種子上面。